18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4436 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  67.39 
 
 		 553 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  72.89 
 
 		 552 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  83 
 
 		 515 aa  764    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  68.7 
 
 		 561 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  71.91 
 
 		 550 aa  676    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1000    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  68.03 
 
 		 559 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  77.21 
 
 		 540 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  72.69 
 
 		 551 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  73.29 
 
 		 547 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  67.68 
 
 		 542 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  73.9 
 
 		 552 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  74.04 
 
 		 552 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  68.09 
 
 		 504 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  68.5 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  65.11 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  45.08 
 
 		 714 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  35.84 
 
 		 620 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>