34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0126 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  89.36 
 
 
547 aa  805    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  75.95 
 
 
537 aa  740    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  96.92 
 
 
551 aa  944    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  97.46 
 
 
559 aa  937    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  72.69 
 
 
509 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  69.36 
 
 
550 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  69.89 
 
 
542 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  98.01 
 
 
561 aa  938    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  85.23 
 
 
552 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  73 
 
 
515 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  84.86 
 
 
552 aa  840    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  67.16 
 
 
553 aa  670    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1082    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  77.25 
 
 
504 aa  760    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  71.68 
 
 
540 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  64.13 
 
 
535 aa  568  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  43.32 
 
 
714 aa  174  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  29.71 
 
 
620 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  27.86 
 
 
402 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  28.57 
 
 
357 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  27.04 
 
 
497 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  26.53 
 
 
501 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  28.8 
 
 
356 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  27.04 
 
 
511 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  26.02 
 
 
495 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  27.04 
 
 
513 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  26.53 
 
 
496 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  26.53 
 
 
491 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  43.64 
 
 
205 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  27.04 
 
 
503 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  29 
 
 
363 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  27.04 
 
 
500 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  31.25 
 
 
358 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  26.92 
 
 
451 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>