227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3838 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  76.88 
 
 		 491 aa  736    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  100 
 
 		 511 aa  1030    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  65.62 
 
 		 461 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  93.37 
 
 		 500 aa  915    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  77.65 
 
 		 495 aa  745    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  98.25 
 
 		 513 aa  984    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  76.92 
 
 		 496 aa  752    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  75.61 
 
 		 501 aa  745    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  76.92 
 
 		 497 aa  728    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  94.52 
 
 		 503 aa  932    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  62.65 
 
 		 433 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  64.06 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  61.61 
 
 		 474 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  64.64 
 
 		 510 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  58.56 
 
 		 490 aa  534  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  57.73 
 
 		 423 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  34.21 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  36.38 
 
 		 451 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  44.29 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  40.15 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  39.83 
 
 		 366 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  58.14 
 
 		 402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  42.42 
 
 		 406 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  45.06 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  45.66 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  50.35 
 
 		 357 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  44 
 
 		 358 aa  147  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  46.99 
 
 		 352 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  44.38 
 
 		 367 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  53.33 
 
 		 378 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  47.77 
 
 		 355 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  50.4 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  48.44 
 
 		 350 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  33.5 
 
 		 620 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  35.71 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  37.7 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  32.5 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  24.28 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  21.52 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  30.64 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0785  hypothetical protein  33.61 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000784162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  26.7 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.16 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  27.82 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  31.3 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  37.38 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  26.7 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  31.3 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  31.5 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3654  permease  31.21 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0586592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  27.37 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  29.76 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  30.1 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  28.64 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  28.47 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  36.7 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  31.4 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0586  capsule polysaccharide transport  36.79 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  29.76 
 
 		 308 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2028  permease  30.95 
 
 		 380 aa  57  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  33.33 
 
 		 324 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  25 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  26.72 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  28.77 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  29.27 
 
 		 354 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  27.32 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  29.87 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2236  permease  34.62 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  33.9 
 
 		 323 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  34.83 
 
 		 354 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  32.5 
 
 		 315 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  30.1 
 
 		 361 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  30.77 
 
 		 315 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  25.41 
 
 		 345 aa  53.5  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  28.66 
 
 		 354 aa  53.5  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  31.37 
 
 		 330 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  28.3 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  36.67 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  28 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  32.71 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  31.45 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  29.69 
 
 		 370 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  36.36 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  27.36 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  27.36 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  27.36 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  27.36 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  32.18 
 
 		 337 aa  52.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  35.85 
 
 		 353 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  37.04 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  27.36 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  33.01 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  27.36 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  35.04 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  27.36 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  29.51 
 
 		 333 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  24.85 
 
 		 312 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  35.44 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  34.04 
 
 		 337 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  27.36 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>