19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4153 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  64.53 
 
 
553 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  69.68 
 
 
552 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  77.05 
 
 
515 aa  698    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  69.2 
 
 
561 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1083    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  75.49 
 
 
509 aa  696    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  70.36 
 
 
559 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  73.5 
 
 
540 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  68.59 
 
 
551 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  73 
 
 
547 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  69.91 
 
 
552 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  70.09 
 
 
552 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  67.09 
 
 
537 aa  628  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  64.97 
 
 
504 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  64.71 
 
 
542 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  62.35 
 
 
535 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  45.85 
 
 
714 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  29.53 
 
 
620 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  55.32 
 
 
205 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>