26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0122 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  76.88 
 
 		 504 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4153  hypothetical protein  68.06 
 
 		 550 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4436  hypothetical protein  72.1 
 
 		 509 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0113064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0122  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1097    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0127  hypothetical protein  97.68 
 
 		 561 aa  959    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0123  hypothetical protein  75.86 
 
 		 537 aa  736    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0608759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4232  hypothetical protein  95.83 
 
 		 551 aa  936    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4829  hypothetical protein  73 
 
 		 515 aa  656    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0122  hypothetical protein  89.36 
 
 		 547 aa  805    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000929066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0044  hypothetical protein  69.74 
 
 		 542 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0126  hypothetical protein  97.28 
 
 		 552 aa  939    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0117  hypothetical protein  85.05 
 
 		 552 aa  839    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303464  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0122  hypothetical protein  84.67 
 
 		 552 aa  837    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.785107  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  67.28 
 
 		 553 aa  666    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3747  hypothetical protein  71.43 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3628  hypothetical protein  63.67 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  43.32 
 
 		 714 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  38.26 
 
 		 620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  31.97 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  28.57 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  28.8 
 
 		 356 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  26.53 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  27.04 
 
 		 497 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  28.71 
 
 		 363 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  26.53 
 
 		 501 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  31.25 
 
 		 358 aa  43.5  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>