262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2503 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2503  permease  100 
 
 		 318 aa  619  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  41.75 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  40.32 
 
 		 301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  38.46 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  36.1 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  37.7 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  38.34 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  35.28 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  35.81 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  36.96 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  36.01 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  35.95 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  35.16 
 
 		 294 aa  202  8e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  38.95 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  37.58 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  40.78 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  37.67 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  31.55 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  35.39 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  35.29 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  36.45 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  36.6 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  34.88 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  37.18 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  36.63 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  37.85 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  34.2 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  34.2 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  40.28 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  37.25 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  36.63 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  35.37 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  37.83 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  31.09 
 
 		 358 aa  189  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  36.33 
 
 		 367 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  32.42 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  35.66 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  31.09 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  36.39 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  36.17 
 
 		 363 aa  185  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  37.94 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  30.03 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  35.52 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  39.43 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  35.14 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  37.9 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  34.62 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  36.79 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  37.74 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  38.1 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  37.5 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  37.89 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  37.67 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  32.39 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  36.11 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  37.89 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  28.8 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  34.82 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  32.14 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  33.85 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  34.78 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  32.36 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  36.11 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  37.54 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  33.12 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  36.64 
 
 		 354 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  34.58 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  35.11 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  31.21 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  36.3 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  31.51 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  35.62 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  35.44 
 
 		 366 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  31.15 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  36.81 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  38.11 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  34.28 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  32.48 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  33.99 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  35.56 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  36.01 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  36.01 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  36.27 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  35.66 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  35.56 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  36.99 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  35.56 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  33.23 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  29.37 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  32.7 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  32.36 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  36.1 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  31.95 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  32.67 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  33.77 
 
 		 370 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  30.38 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  34.51 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  33.66 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  31.33 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  33.02 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>