207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3832 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3958  permease  99.7 
 
 
331 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  100 
 
 
331 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  98.79 
 
 
331 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  99.4 
 
 
331 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  96.68 
 
 
331 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  96.37 
 
 
331 aa  617  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  94.26 
 
 
331 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  79.64 
 
 
335 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  78.98 
 
 
337 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  74.1 
 
 
332 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  77.95 
 
 
336 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  74.1 
 
 
332 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  74.1 
 
 
332 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  72.95 
 
 
330 aa  471  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  70.77 
 
 
328 aa  441  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  68.47 
 
 
338 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  65.56 
 
 
332 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  57.49 
 
 
371 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  50.15 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  48.62 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  48.14 
 
 
322 aa  299  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  46.86 
 
 
323 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  42.06 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  44.14 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  42.46 
 
 
352 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  43.08 
 
 
363 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  42.04 
 
 
330 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  43.38 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  42.15 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  41.72 
 
 
341 aa  269  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  42.86 
 
 
352 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  41.78 
 
 
350 aa  269  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  41.54 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  40.45 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  41.07 
 
 
366 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  40.75 
 
 
366 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  40.26 
 
 
344 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  39.13 
 
 
315 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  40.58 
 
 
353 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  41.01 
 
 
323 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  40.91 
 
 
350 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  42.15 
 
 
354 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  39.62 
 
 
315 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  40.66 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  40.68 
 
 
315 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  41.07 
 
 
381 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  39.41 
 
 
348 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  39.23 
 
 
352 aa  256  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  41.23 
 
 
354 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  41.34 
 
 
324 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  37.62 
 
 
367 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  42.77 
 
 
350 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  37.93 
 
 
315 aa  255  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  43.08 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  40.31 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  37.23 
 
 
319 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  42.3 
 
 
353 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  40.87 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  46.1 
 
 
349 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  43.08 
 
 
370 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  40.06 
 
 
317 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  37.78 
 
 
356 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  40.62 
 
 
351 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  40 
 
 
318 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  40.67 
 
 
351 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  38.15 
 
 
348 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  39.14 
 
 
336 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  41.86 
 
 
353 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  39.44 
 
 
315 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  41.48 
 
 
354 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  43.83 
 
 
318 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  36.09 
 
 
323 aa  235  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  39.23 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  37.27 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  37.42 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  36.91 
 
 
315 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  43.83 
 
 
349 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  41.23 
 
 
332 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  37.27 
 
 
338 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  36.31 
 
 
316 aa  219  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  39.56 
 
 
284 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  37.54 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  38.17 
 
 
318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  37.54 
 
 
318 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  38.49 
 
 
318 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  36.89 
 
 
337 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  35.28 
 
 
337 aa  205  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  34.85 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  32.21 
 
 
311 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  31.54 
 
 
308 aa  175  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  31.99 
 
 
333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  36.33 
 
 
318 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  30.84 
 
 
333 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  28.83 
 
 
356 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  34.34 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  27.99 
 
 
296 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  27.64 
 
 
359 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  25.21 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  29.11 
 
 
306 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  30.21 
 
 
316 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>