237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0864 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0864  permease  100 
 
 
308 aa  593  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  67.54 
 
 
301 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  52.41 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  51.16 
 
 
293 aa  295  7e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  52.07 
 
 
294 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  46.15 
 
 
307 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  49.17 
 
 
300 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  47.42 
 
 
306 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  45.12 
 
 
304 aa  251  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  46 
 
 
316 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  42.94 
 
 
333 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  42.64 
 
 
333 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  43.84 
 
 
345 aa  244  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  43.84 
 
 
345 aa  244  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  41.16 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  43.84 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  42.36 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  40.91 
 
 
359 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  38.66 
 
 
358 aa  235  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  38.66 
 
 
358 aa  235  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  38.4 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  42.36 
 
 
294 aa  233  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  40.06 
 
 
332 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  40.18 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  37.29 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  36.21 
 
 
315 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  36.11 
 
 
315 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  38.06 
 
 
300 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  38.06 
 
 
300 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  33.89 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  36.21 
 
 
315 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  37.07 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  35.76 
 
 
345 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  34.78 
 
 
315 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  32.73 
 
 
350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  33.56 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  35.27 
 
 
351 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  32.38 
 
 
352 aa  179  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  33.22 
 
 
350 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  34.46 
 
 
318 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  33.22 
 
 
364 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  35.12 
 
 
317 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  35.93 
 
 
366 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  35.93 
 
 
366 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  31.63 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  32.88 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  33.22 
 
 
336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  32.68 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  33.21 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  30.9 
 
 
348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  32.65 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  32.23 
 
 
367 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  31.29 
 
 
335 aa  172  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  32.04 
 
 
363 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  32.49 
 
 
331 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  32.29 
 
 
348 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  31.03 
 
 
352 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  34.34 
 
 
324 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  32.55 
 
 
331 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  31.6 
 
 
351 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  32.55 
 
 
319 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  32.62 
 
 
353 aa  168  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  31.77 
 
 
331 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  33.79 
 
 
352 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  33.33 
 
 
351 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  33.01 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  35.52 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  34.25 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  34.56 
 
 
377 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  31.41 
 
 
331 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  31.85 
 
 
337 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  34.31 
 
 
354 aa  165  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  31.41 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  31.48 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  35.16 
 
 
323 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  31.79 
 
 
353 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  34.14 
 
 
315 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  30.43 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  31.83 
 
 
332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  31.83 
 
 
332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  31.96 
 
 
337 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  31.05 
 
 
331 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  33.45 
 
 
331 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  33.83 
 
 
337 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  33.33 
 
 
354 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  31.38 
 
 
354 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  32.78 
 
 
381 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  30.88 
 
 
330 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  32.48 
 
 
338 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  31.08 
 
 
322 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  32.65 
 
 
353 aa  156  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  30.43 
 
 
321 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  31.62 
 
 
337 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  33.21 
 
 
350 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  31.6 
 
 
353 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  31.29 
 
 
319 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  31.29 
 
 
337 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  30.8 
 
 
338 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  30.87 
 
 
362 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  30.23 
 
 
336 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>