235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0397 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  983    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  62.26 
 
 		 461 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  63.28 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  63.16 
 
 		 501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  62.92 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  61.37 
 
 		 433 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  60.52 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  62.65 
 
 		 497 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  63.12 
 
 		 495 aa  544  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  62.43 
 
 		 491 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  60.73 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  60.51 
 
 		 500 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  59.36 
 
 		 511 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  59.66 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  60.81 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  60.54 
 
 		 509 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  40.24 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  38.78 
 
 		 451 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  34.08 
 
 		 475 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  42.74 
 
 		 365 aa  200  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  46.89 
 
 		 366 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  38.36 
 
 		 356 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  50.69 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  55.04 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  38.1 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  54.17 
 
 		 363 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  48.25 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  51.13 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  51.72 
 
 		 355 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  45.58 
 
 		 362 aa  131  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  46.48 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  55.05 
 
 		 367 aa  128  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  41.8 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  36 
 
 		 620 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  22.1 
 
 		 358 aa  86.7  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  22.1 
 
 		 358 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  25.06 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  34.88 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  22.83 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  23.01 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  21.09 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  35.29 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  32.81 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.84 
 
 		 315 aa  67  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0785  hypothetical protein  30.13 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000784162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  31.69 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  23.26 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3654  permease  27.96 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0586592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  29.93 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  29.93 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  29.03 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  34.97 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  33.58 
 
 		 714 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  31.5 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  28.78 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  36.03 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  23.53 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  30.99 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  25.65 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  27.61 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  30.07 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  29.55 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  26.02 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  27.27 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  29.31 
 
 		 294 aa  57  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  31.06 
 
 		 315 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  32.26 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  31.85 
 
 		 359 aa  56.6  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  28.33 
 
 		 633 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  31.82 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  34.19 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  31.16 
 
 		 331 aa  55.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  29.79 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  28.68 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  27.54 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  29.46 
 
 		 611 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  25.83 
 
 		 319 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  26.36 
 
 		 524 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  28.22 
 
 		 330 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  27.95 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  29.27 
 
 		 315 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  34.83 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2236  permease  33.83 
 
 		 526 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  28 
 
 		 288 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  30.94 
 
 		 353 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  28.95 
 
 		 318 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  28.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  28.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  25.79 
 
 		 341 aa  53.9  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  28.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  27.14 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  28.8 
 
 		 318 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  37.5 
 
 		 306 aa  53.9  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  29.03 
 
 		 362 aa  53.9  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  25 
 
 		 317 aa  53.9  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>