217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4202 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4202  transporter  100 
 
 		 352 aa  682    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  72.16 
 
 		 354 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  70.74 
 
 		 354 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  70.64 
 
 		 350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  70.23 
 
 		 351 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  70.5 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  70.11 
 
 		 353 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  65.96 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  68.39 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  66.76 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  62.72 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  60.4 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  72.9 
 
 		 349 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  63.55 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  60.64 
 
 		 352 aa  401  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  63.34 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  62.31 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  62.76 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  57.87 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  67.08 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  60.51 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  62.15 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  63.86 
 
 		 364 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  62.5 
 
 		 344 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  61.09 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  57.64 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  57.1 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  56.84 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  57.59 
 
 		 351 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  60.06 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  65.25 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  54.98 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  53.18 
 
 		 315 aa  335  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  53.55 
 
 		 315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  56.71 
 
 		 315 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  54.78 
 
 		 317 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  56.38 
 
 		 315 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  54.27 
 
 		 349 aa  308  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  52.76 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  46.56 
 
 		 319 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  48.54 
 
 		 323 aa  298  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  50.34 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  45.87 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  52.68 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  44.85 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  50.84 
 
 		 349 aa  281  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  42.68 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  43.85 
 
 		 323 aa  278  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  46.28 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  46.79 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  46.05 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  42.81 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  41.72 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  41.07 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  48.18 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  39.88 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  40.88 
 
 		 332 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  42.86 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  41.9 
 
 		 331 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  42.86 
 
 		 331 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  42.53 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  42.53 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  42.21 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  40.67 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  41.38 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  42.95 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  44.11 
 
 		 334 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  42.63 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  39.94 
 
 		 332 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  39.94 
 
 		 332 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  41.31 
 
 		 371 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  41.9 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  40.61 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  42.33 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  43.43 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  40.13 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  42.81 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  44.85 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  43.04 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  40.96 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  43.29 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  39.42 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  43.67 
 
 		 337 aa  228  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  44.11 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  41.09 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  31.83 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  37.03 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  36.82 
 
 		 301 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  40.37 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  31.8 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  33.79 
 
 		 308 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  28.15 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  31.13 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  28.36 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  35.48 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  27.81 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  27.61 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  28.28 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>