244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3673 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3673  permease  100 
 
 
351 aa  686    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  76.99 
 
 
352 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  84.29 
 
 
351 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  64.35 
 
 
366 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  65.82 
 
 
364 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  66.98 
 
 
366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  60.49 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  57.69 
 
 
352 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  63.99 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  58.29 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  62.5 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  60.29 
 
 
354 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  63.3 
 
 
362 aa  401  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  61.85 
 
 
353 aa  401  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  56.36 
 
 
356 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  61.7 
 
 
348 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  56.77 
 
 
353 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  61.29 
 
 
354 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  60.49 
 
 
345 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  60.91 
 
 
377 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  62.62 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  61.61 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  61.88 
 
 
330 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  60.12 
 
 
381 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  58.57 
 
 
351 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  61.39 
 
 
315 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  55.33 
 
 
367 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  57.64 
 
 
352 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  62.22 
 
 
315 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  59.54 
 
 
351 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  58.86 
 
 
315 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  57.64 
 
 
350 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  59.65 
 
 
353 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  61.18 
 
 
324 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  60.95 
 
 
315 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  56.33 
 
 
315 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  58.54 
 
 
317 aa  355  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  53.46 
 
 
323 aa  353  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  62.03 
 
 
349 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  59.94 
 
 
315 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  56.59 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  52.53 
 
 
323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  51.9 
 
 
323 aa  334  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  51.11 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  48.9 
 
 
319 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  52.72 
 
 
322 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  51.59 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  52.38 
 
 
318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  50.63 
 
 
370 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  49.53 
 
 
319 aa  298  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  50.32 
 
 
321 aa  298  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  46.37 
 
 
336 aa  289  6e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  51.97 
 
 
332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  45.86 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  50 
 
 
318 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  50.48 
 
 
318 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  42.94 
 
 
335 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  44.44 
 
 
331 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  45.06 
 
 
331 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  44.14 
 
 
331 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  47.23 
 
 
331 aa  276  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  44.14 
 
 
331 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  49.68 
 
 
318 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  44.14 
 
 
331 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  43.83 
 
 
331 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  44.14 
 
 
331 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  47.19 
 
 
354 aa  272  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  41.8 
 
 
336 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  41.12 
 
 
332 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  41.12 
 
 
332 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  47.37 
 
 
337 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  40.5 
 
 
332 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  41.1 
 
 
337 aa  266  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  41.5 
 
 
353 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  42.86 
 
 
371 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  39.63 
 
 
330 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  42.17 
 
 
338 aa  255  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  44.12 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  41.56 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  39.45 
 
 
338 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  44.44 
 
 
337 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  45.9 
 
 
337 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  42.81 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  38.8 
 
 
332 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  42.32 
 
 
284 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  34.97 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  34.32 
 
 
301 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  36.05 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  36.24 
 
 
318 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  33.56 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  31.08 
 
 
332 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  29.35 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  32.76 
 
 
306 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  30.9 
 
 
307 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  30.95 
 
 
345 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  30.36 
 
 
345 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  30.36 
 
 
345 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  31.72 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  27.95 
 
 
358 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  32.13 
 
 
300 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>