249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1875 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1875  permease  100 
 
 		 315 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  79.37 
 
 		 315 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  76.19 
 
 		 315 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  77.14 
 
 		 315 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  74.92 
 
 		 315 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  76.83 
 
 		 315 aa  454  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  66.77 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  56.96 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  55.06 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  55.97 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  57.57 
 
 		 330 aa  363  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  56.33 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  56.77 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  57.32 
 
 		 324 aa  361  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  56.41 
 
 		 349 aa  358  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  55.84 
 
 		 351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  55.52 
 
 		 381 aa  349  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  55.91 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  57.38 
 
 		 348 aa  345  8e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  56.41 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  57.19 
 
 		 345 aa  342  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  54.63 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  53.21 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  52.52 
 
 		 356 aa  338  9e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  52.09 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  53.18 
 
 		 352 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  56.23 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  58.39 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  53.77 
 
 		 353 aa  332  5e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  53.57 
 
 		 344 aa  332  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  55.59 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  53.99 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  54.92 
 
 		 377 aa  329  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  55.56 
 
 		 351 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  52.35 
 
 		 341 aa  328  7e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  53.67 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  51.75 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  53.65 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  50.94 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  325  7e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  57.38 
 
 		 353 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  57.43 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  54.63 
 
 		 350 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  52.26 
 
 		 319 aa  319  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  47.78 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  53.87 
 
 		 318 aa  315  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  53.55 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  52.58 
 
 		 318 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  49.51 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  48.89 
 
 		 322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  48.18 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  48.71 
 
 		 349 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  47.92 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  45.77 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  44.55 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  52.82 
 
 		 349 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  46.15 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  47.9 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  39.06 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  46.69 
 
 		 337 aa  278  8e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  48.84 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  42.44 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  48.01 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  44.3 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  45.75 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  39.26 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  40.24 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  40.24 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  42.77 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  38.36 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  41.4 
 
 		 353 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  39.94 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  38.99 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  38.75 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  39.62 
 
 		 331 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  38.49 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  38.49 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  38.36 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  38.17 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  44.53 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  37.93 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  36.05 
 
 		 330 aa  241  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  37.61 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  39.57 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  37.7 
 
 		 316 aa  235  8e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  36.51 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  40.47 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  36.12 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  36.21 
 
 		 308 aa  205  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  37.71 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  34.53 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  34.26 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  32.67 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  31.25 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  32.44 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  30.29 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  30.29 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  31.68 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  31.16 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  28.53 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>