263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0519 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0519  permease  100 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  92.38 
 
 		 315 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  82.54 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  82.54 
 
 		 315 aa  529  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  77.14 
 
 		 315 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  84.13 
 
 		 315 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  67.72 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  60.95 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  58.58 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  57.14 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  55.84 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  55.7 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  59.16 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  58.04 
 
 		 351 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  58.6 
 
 		 362 aa  359  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  60.4 
 
 		 348 aa  358  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  55.92 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  54.78 
 
 		 353 aa  352  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  57.68 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  54.6 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  54.11 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  54.46 
 
 		 363 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  54.92 
 
 		 319 aa  348  6e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  56.05 
 
 		 381 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  60.13 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  56.23 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  54.92 
 
 		 344 aa  345  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  58.98 
 
 		 345 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  55.7 
 
 		 350 aa  345  8e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  54.98 
 
 		 353 aa  344  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  53.33 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  56.51 
 
 		 366 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  56.19 
 
 		 366 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  53.7 
 
 		 341 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  52.35 
 
 		 350 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  51.6 
 
 		 323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  58.78 
 
 		 351 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  56.86 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  53.65 
 
 		 354 aa  328  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  54.29 
 
 		 354 aa  328  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  48.4 
 
 		 323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  54.11 
 
 		 350 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  50.96 
 
 		 319 aa  322  4e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  51.27 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  53.55 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  54.19 
 
 		 351 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  52.9 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  55.05 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  49.84 
 
 		 322 aa  308  5e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  52.58 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  46.58 
 
 		 334 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  45.39 
 
 		 336 aa  295  7e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  49.52 
 
 		 370 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  47.16 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  50.97 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  48.5 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  47.34 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  53.35 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  45.39 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  50 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  40 
 
 		 335 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  48.28 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  46.86 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  46.05 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  45.7 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  46.98 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  47.27 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  39.44 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  40.31 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  39.44 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  39.75 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  39.69 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  39.44 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  39.44 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  39.38 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  41.12 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  38.15 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  38.15 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  37.54 
 
 		 332 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  41.89 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  38.89 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  37.8 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  36.45 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  38.34 
 
 		 371 aa  232  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  35.51 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  34.97 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  37.91 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  37.03 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  34.55 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  35.25 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  33.33 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  33.11 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  34 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  34.51 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  34.15 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  32.44 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  31.23 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  34.22 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  29.11 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  29.85 
 
 		 333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>