240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0507 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  100 
 
 		 356 aa  700    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  76.42 
 
 		 352 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  75.45 
 
 		 353 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  74.55 
 
 		 341 aa  501  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  74.69 
 
 		 350 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  75.39 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  76.43 
 
 		 344 aa  485  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  64.41 
 
 		 351 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  62.54 
 
 		 345 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  67.11 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  58.36 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  56.36 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  57.87 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  58.87 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  59.04 
 
 		 351 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  57.97 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  62.8 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  57.39 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  59.94 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  60 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  59.94 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  57.97 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  56.16 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  58.54 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  61.19 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  55.1 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  56.13 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  56.21 
 
 		 351 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  54.6 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  59.16 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  54.6 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  53.46 
 
 		 315 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  60.57 
 
 		 349 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  52.52 
 
 		 315 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  54.29 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  54.6 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  52.52 
 
 		 317 aa  328  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  50.47 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  51.9 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  49.85 
 
 		 324 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  53.14 
 
 		 315 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  47.83 
 
 		 323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  51.3 
 
 		 322 aa  305  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  46.03 
 
 		 319 aa  301  8.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  45.07 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  47.41 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  44.62 
 
 		 323 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  47.13 
 
 		 321 aa  288  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  41.93 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  43.61 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  46.45 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  47.08 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  41.64 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  46.08 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  42.27 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  44.83 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  46.71 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  42.68 
 
 		 319 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  47.25 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  41.69 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  39.87 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  38.84 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  37.97 
 
 		 335 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  44.34 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  38.66 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  38.1 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  38.1 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  40.9 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  37.46 
 
 		 332 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  37.78 
 
 		 331 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  38.19 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  37.78 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  37.78 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  37.46 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  37.22 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  37.22 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  44.55 
 
 		 337 aa  242  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  44.62 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  38.04 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  38.7 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  37.31 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  36.34 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  39.32 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  40.81 
 
 		 284 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  36.45 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  34.92 
 
 		 318 aa  203  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  34.81 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  33.66 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  35.93 
 
 		 318 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  34.93 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  32.65 
 
 		 308 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  29.85 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  29.55 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  29.55 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  31.5 
 
 		 332 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  28.15 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  31.56 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  30.79 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  26.93 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  26.93 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>