244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3659 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3659  permease  100 
 
 
349 aa  673    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  61.98 
 
 
354 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  61.13 
 
 
370 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  52.81 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  50.57 
 
 
353 aa  342  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  51.59 
 
 
351 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  53.55 
 
 
324 aa  317  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  51.95 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  54.13 
 
 
351 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  50.97 
 
 
315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  48.71 
 
 
315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  47.41 
 
 
356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  48.93 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  47.18 
 
 
352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  49.35 
 
 
315 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  51.16 
 
 
330 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  49.01 
 
 
348 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  52.98 
 
 
354 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  45.85 
 
 
367 aa  298  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  49.55 
 
 
348 aa  298  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  51.94 
 
 
315 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  43.3 
 
 
353 aa  296  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  50.96 
 
 
315 aa  296  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  48.82 
 
 
344 aa  291  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  48.52 
 
 
350 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  52.32 
 
 
354 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  51.7 
 
 
351 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  50.84 
 
 
352 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  50.46 
 
 
381 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  50.99 
 
 
322 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  47.95 
 
 
321 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  46.99 
 
 
341 aa  289  6e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  49.83 
 
 
364 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  50.97 
 
 
315 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  48.48 
 
 
350 aa  286  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  48.84 
 
 
363 aa  285  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  44.87 
 
 
323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  49.67 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  47.7 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  49.67 
 
 
350 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  44.97 
 
 
319 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  48.1 
 
 
362 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  49.18 
 
 
353 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  51.64 
 
 
377 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  46.11 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  45.66 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  49.01 
 
 
366 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  49.35 
 
 
318 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  46.77 
 
 
323 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  46.02 
 
 
353 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  48.7 
 
 
318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  47.48 
 
 
319 aa  268  8e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  44.27 
 
 
331 aa  268  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  44.59 
 
 
323 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  45.16 
 
 
332 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  44.44 
 
 
335 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  47.4 
 
 
318 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  42.9 
 
 
319 aa  264  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  44.38 
 
 
330 aa  259  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  45.51 
 
 
332 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  45.51 
 
 
332 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  42.9 
 
 
334 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  45.63 
 
 
331 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  45.95 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  49.01 
 
 
349 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  45.63 
 
 
331 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  44.98 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  45.31 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  45.31 
 
 
331 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  48.68 
 
 
332 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  45.31 
 
 
331 aa  249  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  44.05 
 
 
337 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  43.45 
 
 
337 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  41 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  44.68 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  44.04 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  39.55 
 
 
336 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  44.26 
 
 
337 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  44.41 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  43.59 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  42.5 
 
 
337 aa  235  7e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  41.67 
 
 
338 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  45.48 
 
 
371 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  44.66 
 
 
284 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  45.3 
 
 
332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  36.07 
 
 
316 aa  211  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  40.26 
 
 
318 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  34.55 
 
 
301 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  35.52 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  37.07 
 
 
318 aa  179  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  32.68 
 
 
311 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  30.82 
 
 
304 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  32.25 
 
 
307 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  31.05 
 
 
306 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  29.39 
 
 
316 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  31.54 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  29.57 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  27.87 
 
 
356 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  29.55 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  29.73 
 
 
358 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>