183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0849 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0849  permease  100 
 
 		 316 aa  625  1e-178  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  37.7 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  40.51 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  36.34 
 
 		 335 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  36.48 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  37.95 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  37.22 
 
 		 332 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  37.22 
 
 		 332 aa  228  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  37.09 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  36.09 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  36.48 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  38.69 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  39.6 
 
 		 323 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  37.83 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  38.54 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  39.94 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  36.91 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  37.7 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  36.31 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  36.62 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  35.44 
 
 		 331 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  35.53 
 
 		 352 aa  215  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  34.97 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  34.75 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  36.62 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  36.63 
 
 		 362 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  36.31 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  35.33 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  33.11 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  36.31 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  35.91 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  36.31 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  34.75 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  33.55 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  35.53 
 
 		 322 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  36.63 
 
 		 370 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  33.77 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  34.21 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  36.31 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  35.27 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  35.2 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  34.87 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  34.64 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  34.87 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  34.59 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  35.41 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  34.53 
 
 		 348 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  34.67 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  36.93 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  36.36 
 
 		 377 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  36.07 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  33.66 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  33.33 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  34.97 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  33.11 
 
 		 354 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  34.81 
 
 		 356 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  35.81 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  35.76 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  31.83 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  32.91 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  33.88 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  33.54 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  33.11 
 
 		 354 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  32.81 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  34.67 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  34.19 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  33.77 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  37.46 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  32.59 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  35.47 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  36.1 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  34.64 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  38.94 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  31.96 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  39.2 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  34.87 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  38.28 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  34.58 
 
 		 351 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  34.36 
 
 		 371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  34.09 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  33.22 
 
 		 349 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  29.41 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  37.12 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  35.2 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  33.33 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  35.16 
 
 		 318 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  35.45 
 
 		 337 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  31.94 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  30.69 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  30.69 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  28.83 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  30.47 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  28.27 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  28.87 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  27.86 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  32.08 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  25.26 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  27.11 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  29.07 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  27.55 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>