228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0731 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0731  permease  100 
 
 		 337 aa  661    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  76.26 
 
 		 337 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  72.51 
 
 		 331 aa  499  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  72.4 
 
 		 337 aa  491  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  75.37 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  61.24 
 
 		 336 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  59.69 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  62.9 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  58.28 
 
 		 338 aa  358  8e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  58.13 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  58.28 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  50.48 
 
 		 318 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  46.91 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  45.51 
 
 		 315 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  44.3 
 
 		 315 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  42.9 
 
 		 349 aa  278  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  46.43 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  44.77 
 
 		 324 aa  276  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  45.9 
 
 		 323 aa  275  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  45.75 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  46.03 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  45.36 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  45.36 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  44.08 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  45.7 
 
 		 315 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  44.12 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  44.12 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  44.87 
 
 		 344 aa  268  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  49.04 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  44.34 
 
 		 356 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  43.37 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  42.05 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  48.41 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  46.86 
 
 		 315 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  42.95 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  43.24 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  44.01 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  42.76 
 
 		 364 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  46.96 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  48.08 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  47.37 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  43.18 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  41.67 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  43.08 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  45 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  42.9 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  42.55 
 
 		 341 aa  255  9e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  39.87 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  43.51 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  42.11 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  44.04 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  43.14 
 
 		 363 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  43.04 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  45.07 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  44.3 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  40.82 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  43.42 
 
 		 366 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  43.42 
 
 		 366 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  42.33 
 
 		 351 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  43.05 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  42.11 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  41.45 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  41.78 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  42.5 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  37.58 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  42.81 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  35.6 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  35.6 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  35.94 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  34.94 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  38.69 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  35.28 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  35.28 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  36.96 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  35.28 
 
 		 331 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  35.28 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  35.92 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  35.6 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  35.6 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  37.07 
 
 		 371 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  36.45 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  34.5 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  33.23 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  33.44 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  33.54 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  32.7 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  34.5 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  35.08 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  33.1 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  30.61 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  31.74 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  29.11 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  30.03 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  29.32 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  27.81 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  28.85 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  31.9 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  28.71 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  28.08 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  28.71 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>