228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2048 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2048  permease  100 
 
 		 336 aa  658    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  66.57 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  66.36 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  67.27 
 
 		 334 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  64.5 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  64.65 
 
 		 337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  61.24 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  57.96 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  62.32 
 
 		 284 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  58.97 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  53.18 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  59.27 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  47.92 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  46.28 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  45.15 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  47.92 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  47.4 
 
 		 352 aa  291  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  47.92 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  47.51 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  46.37 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  45.95 
 
 		 348 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  45.73 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  44.64 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  44.85 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  42.91 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  45.89 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  46.43 
 
 		 319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  43.71 
 
 		 323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  46.21 
 
 		 353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  43.05 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  48.61 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  44.37 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  44.65 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  44.14 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  46.92 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  46.21 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  50.64 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  45.05 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  41.2 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  49.68 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  47.32 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  49.68 
 
 		 318 aa  275  7e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  44.48 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  42.76 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  44.29 
 
 		 353 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  46.88 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  42.27 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  42.81 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  43.89 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  46.71 
 
 		 319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  40.32 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  42.91 
 
 		 363 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  42.32 
 
 		 350 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  43.1 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  48.79 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  40.38 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  40.38 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  43 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  39.56 
 
 		 349 aa  251  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  40.41 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  44.59 
 
 		 349 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  42.66 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  38.21 
 
 		 319 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  39.16 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  39.14 
 
 		 331 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  39.14 
 
 		 331 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  38.49 
 
 		 331 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  39.14 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  38.49 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  38.49 
 
 		 331 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  38.49 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  36.96 
 
 		 332 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  37.99 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  38.19 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  37.09 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  37.09 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  40.48 
 
 		 354 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  38.61 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  39.67 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  39.55 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  38.26 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  38.76 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  35.26 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  36.89 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  37.54 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  32.61 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  35.47 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  35.42 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  30.93 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  31.46 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  34.05 
 
 		 296 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  30.14 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  30.23 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  29.77 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  30.82 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  26.85 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  30.1 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  30.1 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  27.81 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  27.79 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>