206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05267 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  754    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  73.88 
 
 
373 aa  545  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  75.2 
 
 
345 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  73.54 
 
 
356 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  74.07 
 
 
345 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  74.07 
 
 
345 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  66.75 
 
 
358 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  66.49 
 
 
358 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  67.37 
 
 
358 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  63.87 
 
 
332 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  56.88 
 
 
307 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  59.46 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  48.52 
 
 
359 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  48.66 
 
 
333 aa  318  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  48.39 
 
 
333 aa  318  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  72.96 
 
 
304 aa  242  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  70.06 
 
 
306 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  34.68 
 
 
300 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  30.64 
 
 
315 aa  176  6e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  29.81 
 
 
318 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  30.18 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  28.88 
 
 
324 aa  162  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  27.75 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  33.43 
 
 
301 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  25.47 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  26.4 
 
 
332 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  48.99 
 
 
308 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  26.98 
 
 
332 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  26.98 
 
 
332 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  53.72 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  26.49 
 
 
337 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  25 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  40.94 
 
 
311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  44.29 
 
 
294 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  37.97 
 
 
350 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  25.67 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  42.03 
 
 
294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  38.15 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  32.5 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  42.96 
 
 
296 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  35.03 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  32.42 
 
 
213 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  37.68 
 
 
350 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  32.12 
 
 
341 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  34.44 
 
 
356 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  35.85 
 
 
319 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  37.68 
 
 
353 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  41.53 
 
 
345 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  32.76 
 
 
349 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  33.8 
 
 
315 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  25 
 
 
331 aa  103  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  39.52 
 
 
300 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  39.52 
 
 
300 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  32.43 
 
 
315 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  31.71 
 
 
322 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  38.46 
 
 
348 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  31.48 
 
 
348 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  38.41 
 
 
351 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  34.25 
 
 
351 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  34.69 
 
 
351 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  40 
 
 
366 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  40 
 
 
366 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  36.89 
 
 
315 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  34.97 
 
 
315 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  37.06 
 
 
331 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  37.06 
 
 
331 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  36.05 
 
 
317 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  35.92 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  34.97 
 
 
315 aa  99.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  33.8 
 
 
350 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  36.75 
 
 
364 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  34.06 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  38.33 
 
 
351 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  36.36 
 
 
331 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  35.66 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  36.07 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  35.66 
 
 
331 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  39.17 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  31.47 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  35.66 
 
 
331 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  35.51 
 
 
354 aa  96.3  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  34.03 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  34.46 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  32.35 
 
 
319 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  34.78 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  35.66 
 
 
331 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  32.64 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  30.43 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  25.07 
 
 
337 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  32.18 
 
 
338 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  31.93 
 
 
336 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  37.5 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  29.01 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  25.89 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  34.75 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  38.02 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  34.01 
 
 
315 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  31.14 
 
 
284 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  34.15 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  33.06 
 
 
332 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>