213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3596 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  741    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  73.88 
 
 		 378 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  72.61 
 
 		 356 aa  534  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  70.74 
 
 		 345 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  65.96 
 
 		 358 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  65.7 
 
 		 358 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  70.21 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  70.21 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  68.98 
 
 		 358 aa  480  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  66.22 
 
 		 332 aa  475  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  57.64 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  59.02 
 
 		 316 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  50.55 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  49.06 
 
 		 333 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  48.78 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  69.81 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  66.87 
 
 		 306 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  38.4 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  31.27 
 
 		 318 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  29.3 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  28.61 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  29.61 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  53.29 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  26.04 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  26.24 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  27 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  27.15 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  25.52 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  26.71 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  26.41 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  26.71 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  25.52 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  25.52 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  26.27 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  51.15 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  27.06 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  26.19 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  38.15 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  46.85 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  45.93 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  26.69 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  26.29 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  26.29 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  25.47 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  36.62 
 
 		 213 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  42.22 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  34.68 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  36.14 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  37.43 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  36.75 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  39.13 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  40 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  39.83 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  40.32 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  40.32 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  38.89 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  35.03 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  31.79 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  35.12 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  36.44 
 
 		 315 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  37.61 
 
 		 348 aa  99.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  34.13 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  31.54 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  40.8 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  37.5 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  34.92 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  35.37 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  37.76 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  40.8 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  40 
 
 		 348 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  24.93 
 
 		 433 aa  96.3  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  34.23 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  34.76 
 
 		 350 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  33.12 
 
 		 330 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  36.65 
 
 		 331 aa  96.3  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  30.72 
 
 		 323 aa  95.9  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  36.36 
 
 		 315 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  36.07 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  31.93 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  37.68 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  36.75 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  38.33 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  35.83 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  32.87 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  31.51 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  34.06 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  35.71 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  36.49 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  35 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  29.88 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  40.83 
 
 		 353 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  38.33 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  33.11 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  30.87 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  32.24 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  34.81 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  36.05 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  33.76 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  24.74 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  33.53 
 
 		 318 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>