224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0944 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0944  transporter  100 
 
 
347 aa  684    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  49.72 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  49.72 
 
 
392 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  46.28 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  44.61 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  48.58 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  48.4 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  48.06 
 
 
361 aa  299  5e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  48.12 
 
 
356 aa  297  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  46.25 
 
 
362 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  45.97 
 
 
362 aa  296  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  49.86 
 
 
390 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  46.91 
 
 
359 aa  290  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  47.13 
 
 
389 aa  289  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  46.61 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  45.48 
 
 
343 aa  282  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  47.31 
 
 
350 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  49.73 
 
 
393 aa  281  8.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  46.86 
 
 
389 aa  279  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  43.27 
 
 
357 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  47.03 
 
 
359 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  44.61 
 
 
343 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  43.96 
 
 
433 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  40.66 
 
 
437 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  36.29 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  59.42 
 
 
461 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  48.15 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  51.7 
 
 
489 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  54.61 
 
 
479 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.65 
 
 
294 aa  102  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  26.86 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  27.18 
 
 
363 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  22.25 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.71 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.48 
 
 
402 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.76 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  25.89 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25 
 
 
357 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.62 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.17 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.13 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  25.64 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  24.3 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  25.32 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  24.46 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.1 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  23.84 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  24.91 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  23.53 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  23.08 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  23.87 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  24.48 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  22.65 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  23.64 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  23.34 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  22.65 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  22.92 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  23.82 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  26.38 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  22.68 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  24.23 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  22.32 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  22.79 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  20.63 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  23.15 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  23.45 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  24.4 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  22.41 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  22.37 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  22.32 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  22.36 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  20.8 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  23.4 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  22.69 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  21.93 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  24.82 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  24.03 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  22.37 
 
 
315 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  24.03 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  24.11 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  23.26 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  22.02 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  21.73 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  21.73 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  21.04 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  23.05 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  22.67 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  21.56 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  22.22 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  21.71 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  22.11 
 
 
300 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  22.11 
 
 
300 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  21.69 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  19.55 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  32.06 
 
 
475 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  20.77 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  23.66 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  20.51 
 
 
345 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  19.75 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  22.85 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>