226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0828 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0828  permease  100 
 
 
361 aa  705    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  75.14 
 
 
362 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  75.14 
 
 
362 aa  547  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  49.74 
 
 
393 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  45.69 
 
 
389 aa  315  7e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  45.6 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  45.69 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  47.4 
 
 
389 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  46.23 
 
 
393 aa  305  9.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  46.89 
 
 
390 aa  299  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  44.62 
 
 
389 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  48.06 
 
 
347 aa  296  5e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  47.54 
 
 
343 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  41.29 
 
 
356 aa  279  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  45.53 
 
 
350 aa  277  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  49.56 
 
 
359 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  42.21 
 
 
357 aa  277  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  44.25 
 
 
367 aa  268  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  47.48 
 
 
343 aa  266  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  40.8 
 
 
433 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  43.35 
 
 
350 aa  259  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  47.83 
 
 
343 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  42.09 
 
 
359 aa  248  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  36.52 
 
 
461 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  40 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  49.11 
 
 
437 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  44.63 
 
 
489 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  43.03 
 
 
452 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  54.03 
 
 
479 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  26.53 
 
 
294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  24.19 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  25.34 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  25 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  25.29 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  22.73 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  26.01 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  22.73 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  27.02 
 
 
315 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  26.2 
 
 
338 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  25.4 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  27.61 
 
 
337 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  23.18 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25.71 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  26.57 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  25.23 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  25.23 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  25.16 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  25.16 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  25.08 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  25.42 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.62 
 
 
402 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  24.92 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  23.62 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  25.83 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  23.31 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  26.03 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  23.41 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  25.52 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  26.37 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  22.69 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  25.4 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  25.29 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  25.4 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  22.26 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  26.69 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  24.74 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  23.32 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1936  putative permease  45.68 
 
 
111 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0118434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  25.39 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  21.41 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  24.75 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.9 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  25.57 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  24.7 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  24.12 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  23.41 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  22.61 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  26.32 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  24.04 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  24.92 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  22.68 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.29 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  24.38 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  22.93 
 
 
293 aa  75.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  22.88 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  22.36 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  23.15 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  24.34 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  24.21 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  23.28 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  23.91 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.86 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  24.92 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  22.78 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  23.84 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  23.77 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  25.16 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  21.88 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  23.59 
 
 
296 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>