191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0785 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0785  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000784162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  69.36 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  28.03 
 
 		 365 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.14 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  24.91 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  25.25 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  28.04 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  26.77 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  27.08 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  30.34 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25.08 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.92 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  26.84 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  23.18 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  25.91 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.16 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  23.42 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  27.47 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  23.84 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  26.05 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  24.24 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  26.35 
 
 		 620 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  25.1 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  26.52 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  26.52 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  26.52 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  22.3 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.31 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  26.47 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  23.01 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.69 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  24.03 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  25.19 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  26.2 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0586  capsule polysaccharide transport  27.6 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  26.64 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  25 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  23.46 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  26.69 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  35.29 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.85 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  24.06 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  25.18 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  20.98 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  23.66 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  22.9 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  26.14 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  28.52 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  22.73 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  29.75 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  35.29 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  22.57 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  23.62 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  34.45 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  24.11 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  25.77 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  21.97 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  33.61 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  33.61 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  33.61 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  31.3 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  33.61 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  33.61 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  24.49 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  21.81 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  24.03 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  25.6 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  32.79 
 
 		 491 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  23.31 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  23.44 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  21.48 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  32.77 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  23.08 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  25 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  22.03 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  22.65 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  24.09 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3654  permease  23.96 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0586592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  32.79 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  32.77 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  23.05 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  32.77 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  21.4 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.97 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  26.55 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  32.77 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  22.44 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  22.02 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  23.1 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  22.44 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  24.45 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.24 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  33.61 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  24.62 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  26.4 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  21.96 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  24.62 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  25.72 
 
 		 611 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  23.89 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  26.4 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>