201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2907 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1217    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  80.85 
 
 		 633 aa  977    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  27.13 
 
 		 343 aa  106  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  24.36 
 
 		 323 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  25.17 
 
 		 337 aa  90.9  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  25.56 
 
 		 323 aa  90.5  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.15 
 
 		 311 aa  88.2  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  26.59 
 
 		 308 aa  87  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  23.49 
 
 		 331 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.24 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  22.19 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  23.55 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  27.72 
 
 		 301 aa  83.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  24.56 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  25.34 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  25.64 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  24.21 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  24.21 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  24.21 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  22.88 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  23.05 
 
 		 297 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  26.23 
 
 		 331 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0586  capsule polysaccharide transport  25.33 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  22.83 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  24.45 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  25.08 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  23.03 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  25.82 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22.39 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3654  permease  23.73 
 
 		 341 aa  77  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0586592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  23.53 
 
 		 321 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  26.86 
 
 		 318 aa  76.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  24.07 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  20.95 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  23 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  23.51 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  22.76 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.05 
 
 		 352 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  27.51 
 
 		 300 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  24.58 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  24.15 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  24.15 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  24.63 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  23.02 
 
 		 366 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  24.65 
 
 		 322 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  22.97 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  24.34 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.74 
 
 		 319 aa  72  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  22.22 
 
 		 350 aa  72  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  22.51 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  23.4 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  22.94 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  23.02 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  22.86 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  22.79 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  23.49 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  21.83 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  22.39 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  20.25 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  26.18 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  23.13 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  24.66 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  24.31 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  22.53 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  22.81 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  22.33 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  20.65 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  21.09 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  23.72 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.64 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  22.5 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  23.02 
 
 		 336 aa  67  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  24.09 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  21.69 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  22.06 
 
 		 315 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  21.59 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  21.84 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  22.37 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  23.61 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  21.97 
 
 		 298 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  24.32 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  22.33 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  21.4 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  22.02 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  23.55 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  22.37 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  23.9 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  21.61 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  23.58 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  22.75 
 
 		 341 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  23.31 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  21.4 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  21.8 
 
 		 345 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  22.09 
 
 		 358 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  26.72 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  22.03 
 
 		 333 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  23 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  22.42 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  21.48 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  19.12 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>