112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4946 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4946  permease  100 
 
 
341 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  68.97 
 
 
343 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  68.97 
 
 
343 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  60.71 
 
 
350 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  59.13 
 
 
350 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  57.14 
 
 
362 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  55.56 
 
 
335 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  58.46 
 
 
336 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  36.81 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  36.81 
 
 
328 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  39.57 
 
 
325 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  40.19 
 
 
318 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  30.82 
 
 
300 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  38.92 
 
 
318 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  31.95 
 
 
371 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  34.5 
 
 
346 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  38.51 
 
 
323 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  34.76 
 
 
288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  31.63 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  31.8 
 
 
300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  30.35 
 
 
325 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  30.35 
 
 
325 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  30.67 
 
 
324 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  31.93 
 
 
297 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  30.67 
 
 
324 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  33.72 
 
 
358 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  33.33 
 
 
297 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  31.01 
 
 
325 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  31.78 
 
 
312 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  29.72 
 
 
524 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  29.97 
 
 
288 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  28.79 
 
 
342 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  32.48 
 
 
370 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  29.97 
 
 
524 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  31.63 
 
 
334 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  32.13 
 
 
343 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  29.91 
 
 
332 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  30.03 
 
 
364 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  30.67 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  47.11 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  46.28 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  46.28 
 
 
298 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  45.45 
 
 
298 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  45.45 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  45.45 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  45.45 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  45.45 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  45.45 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  45.45 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  45.45 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  29.56 
 
 
368 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  44.12 
 
 
365 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  42.06 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  38.58 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  39.77 
 
 
620 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  31.07 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  19.08 
 
 
363 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.93 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  23.8 
 
 
633 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  21.28 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  20.45 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  20.95 
 
 
433 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  22.75 
 
 
611 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  21.08 
 
 
461 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  26.06 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  32.32 
 
 
363 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  31.78 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.63 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  26.39 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  22.03 
 
 
311 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  20.62 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  31.43 
 
 
300 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  31.43 
 
 
300 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  23 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.81 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  28.12 
 
 
308 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  27.18 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  22.59 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  25 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  20.46 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  30.59 
 
 
474 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  27.88 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  24 
 
 
302 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  37.5 
 
 
335 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  39.29 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  31.76 
 
 
378 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  32.35 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  32.35 
 
 
332 aa  46.2  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  29.51 
 
 
352 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  22.29 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  21.6 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  37.5 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  37.5 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  32.81 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  35.82 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  37.5 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  32.81 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  24.67 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  25.93 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  37.5 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>