174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0584 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0584  permease, putative  100 
 
 		 312 aa  614  1e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  43.05 
 
 		 524 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  39.06 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  39.06 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  41.3 
 
 		 524 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  34.34 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  34.44 
 
 		 371 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  37.58 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  33.67 
 
 		 324 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  33.77 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  33.77 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  33.89 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  34.71 
 
 		 346 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  33.55 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  38.41 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  34.88 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  37.99 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  37.99 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  37.99 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  37.99 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  37.99 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  37.99 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  37.99 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  37.99 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  37.99 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  37.63 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  33.33 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  33.33 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  33.93 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  32.34 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  32.34 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  32.92 
 
 		 350 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  31.21 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  30.14 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  30.28 
 
 		 335 aa  145  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  31.21 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  31.05 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  30.84 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  30.26 
 
 		 358 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  30.07 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  28.85 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  31.31 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  30.88 
 
 		 352 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  28.62 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  29.69 
 
 		 350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  25.55 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  30.25 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  25.75 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  25.75 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  26.74 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  26.46 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  26.69 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.17 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  25.34 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  31.13 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  24.91 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  24.63 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  22.62 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  22.76 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  27.24 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  22.89 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  22.3 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  22.3 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  24.87 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.91 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  23.2 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.55 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  28.17 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  20.58 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  21.94 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.49 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.11 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  22.68 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  22.06 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  22.01 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  24.6 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  23.05 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  22.05 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  22.05 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  23.76 
 
 		 620 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  20.64 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  21 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  27.21 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  21 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  20.82 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  24.67 
 
 		 633 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  21.91 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  28.12 
 
 		 475 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  28.87 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  29.61 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  24.19 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  24.7 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  30.66 
 
 		 378 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  21.09 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  21.49 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  22.13 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21.26 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  30.77 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  23.33 
 
 		 352 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>