226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0714 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0714  permease  100 
 
 
300 aa  597  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  69.67 
 
 
300 aa  434  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  51.69 
 
 
288 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  47.2 
 
 
298 aa  262  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  49.45 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  49.45 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  49.45 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  49.45 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  49.45 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  49.82 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  49.45 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  49.45 
 
 
298 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  49.45 
 
 
298 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  49.45 
 
 
298 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  48.34 
 
 
288 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  39.29 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  39.16 
 
 
371 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  38.25 
 
 
325 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  38.25 
 
 
325 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  41.58 
 
 
346 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  37.89 
 
 
324 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  37.89 
 
 
324 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  38.69 
 
 
297 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  38.69 
 
 
297 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  31.99 
 
 
524 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  32.71 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  30.24 
 
 
350 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  32.69 
 
 
343 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  32.69 
 
 
343 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  31.8 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  34.05 
 
 
312 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  34.08 
 
 
358 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  33.1 
 
 
334 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  33.57 
 
 
524 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  31.01 
 
 
350 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  36.11 
 
 
332 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  33.45 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  32.19 
 
 
370 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  35.56 
 
 
352 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  33 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  32.94 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  35.83 
 
 
318 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  32.75 
 
 
343 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  27.86 
 
 
364 aa  123  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  31.33 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  35.38 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  31.93 
 
 
350 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  46.15 
 
 
362 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  28.97 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  28.97 
 
 
328 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  32.3 
 
 
368 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  32.58 
 
 
357 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  36.18 
 
 
365 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  25.62 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.1 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.45 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.78 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  25.19 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  25.5 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.58 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  26.41 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  26.17 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  22.64 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  21.48 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  24.67 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  23.64 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  25.89 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  23.64 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  21.43 
 
 
352 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  22.46 
 
 
356 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  21.8 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  22.7 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  22.15 
 
 
633 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  23.25 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22.66 
 
 
363 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  24.42 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  20 
 
 
352 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  22.34 
 
 
353 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  22.38 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  24.48 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  22.18 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  25.29 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.58 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  27.42 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  21.38 
 
 
357 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  20.94 
 
 
406 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  22.18 
 
 
611 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  20.12 
 
 
402 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  23.76 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  22.44 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  24.62 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  21.62 
 
 
362 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  24.28 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  22.54 
 
 
367 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  21.92 
 
 
348 aa  59.7  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  21.98 
 
 
378 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  22.31 
 
 
348 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  22.65 
 
 
381 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  22.93 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>