192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0586 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0586  capsule polysaccharide transport  100 
 
 		 348 aa  681    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3654  permease  61.13 
 
 		 341 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0586592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  57.23 
 
 		 343 aa  348  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  28.52 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  30.48 
 
 		 301 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  26.86 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  26.37 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  25.19 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  28.57 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  26.38 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  27.11 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  25.64 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  29.41 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  25.75 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  25.19 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  28.46 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  24.51 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  23.38 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  25.86 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  28.4 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  24.18 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  31.8 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  21.59 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  28.73 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  25.1 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  24.9 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  25.08 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  25 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  25.23 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  27.41 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  23.08 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  23.08 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  26.64 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  22.27 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  24.9 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  26.88 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  24.3 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  25.58 
 
 		 633 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  25.47 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  25.59 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.43 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  24.04 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  23.79 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  24.84 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  26.46 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  26.69 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  22.34 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  24.41 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  23.67 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  28.52 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  25 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  23.56 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  23.46 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  23.85 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  25 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.92 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  23.08 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  24.92 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.23 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  25.93 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  24.51 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  23.62 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  25 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  24.31 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  22.83 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  22.12 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  23.51 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  25.84 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  27.31 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  25.29 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  25.47 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22.75 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  22.89 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  22.16 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  24.12 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.63 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  25.47 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  21.24 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  28.52 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  21.26 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  22.61 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  23.23 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  23.67 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  24.92 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  25.59 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  24.49 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  25.17 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  27.05 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  24.41 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  23.99 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  22.83 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  25.08 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  22.74 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  23.72 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  24.91 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  25.25 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  21.57 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>