215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0456 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0456  permease  100 
 
 		 367 aa  707    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  63.48 
 
 		 359 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  44.72 
 
 		 347 aa  305  7e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  47.04 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  47.04 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  45.45 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  47.78 
 
 		 393 aa  273  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  44.68 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  44.25 
 
 		 361 aa  265  7e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  48.89 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  46.2 
 
 		 350 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  46.18 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  42.69 
 
 		 362 aa  257  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  42.98 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  45.45 
 
 		 343 aa  255  9e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  45.96 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  42.74 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  44.57 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  41.46 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  46.31 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  39.5 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  40.3 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  42.9 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  38.21 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  38.44 
 
 		 433 aa  222  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  38.16 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  34.94 
 
 		 452 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  44.44 
 
 		 489 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  48.25 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25.88 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  26.2 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  24.78 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.53 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  24.26 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  25.9 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  22.82 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  23.2 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  25.91 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  22.88 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  23.97 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  23.36 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  23.36 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.05 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  24.05 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  23.68 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  24.09 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  23.59 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  21.54 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.73 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  24.84 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  21.23 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  22.37 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  31.4 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.69 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  21.74 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  26.5 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  26.5 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  30.58 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  23.88 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  27.21 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  22.34 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  23.36 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  36.61 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  21.61 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  22.35 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  26.95 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  32.23 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  22.7 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  22.11 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  21.13 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  20.07 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  20.63 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  21.75 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  21.23 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  21.53 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  20.58 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  19.72 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  20.47 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  21.48 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  20.77 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  21.13 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  27.78 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  21.13 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  25.89 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  26.47 
 
 		 315 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0586  capsule polysaccharide transport  30.69 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  21.55 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  21.13 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  28.57 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  22.26 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3654  permease  28.23 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0586592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  24.44 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  25.41 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  24.07 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  25.76 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  25.76 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  27.13 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  25.76 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  24.07 
 
 		 213 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>