110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6565 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  96.58 
 
 		 351 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  100 
 
 		 351 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4731  putative transporter  70.45 
 
 		 352 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908679  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1113  permease  70.17 
 
 		 352 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1593  permease  70.17 
 
 		 352 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1570  permease  70.45 
 
 		 352 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1509  permease  70.17 
 
 		 352 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0642065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  70.45 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1644  permease  70.17 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1637  permease  73.37 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  69.34 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2489  transporter, putative  68.38 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1221  transporter, putative  68.09 
 
 		 353 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1706  putative transporter  68.09 
 
 		 353 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0363  putative transporter  68.09 
 
 		 353 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1837  permease  68.38 
 
 		 353 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1850  putative permease  68.38 
 
 		 353 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0798  putative transporter  68.09 
 
 		 353 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2005  hypothetical protein  69.77 
 
 		 301 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  52.8 
 
 		 373 aa  335  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  51.94 
 
 		 346 aa  328  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  51.64 
 
 		 346 aa  328  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  51.64 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  51.64 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  51.64 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  51.34 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  51.34 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  51.04 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  50.9 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  46.86 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.89 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  23.23 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  22.76 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  24.24 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  21.09 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  25 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  40.58 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  36.84 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  21.86 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  39.74 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  39.74 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  22.47 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  22.4 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22.01 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  26.39 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  26.35 
 
 		 357 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  24.6 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  26.97 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  20.27 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  24.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  23.3 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  21.52 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  21.92 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  21.79 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  20.08 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  21.74 
 
 		 367 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  21.5 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2028  permease  31.78 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  23.23 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0954  hypothetical protein  27.51 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  21.26 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.22 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  32.56 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  21.61 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.32 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  28.99 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  30.34 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  25.21 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  31.69 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  38.96 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  24.9 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  29.86 
 
 		 490 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  27.17 
 
 		 489 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  24.14 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  23.88 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  19.8 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  34.78 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  19.93 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  24.26 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  23.87 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  23.9 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  23.79 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3894  permease  32 
 
 		 376 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  22.69 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  26.54 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0592  permease  28.97 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568348  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  29.13 
 
 		 461 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  20.69 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  22.9 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  30.14 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  24.82 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  30.14 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  30.08 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  23.35 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  25.11 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  23.35 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  37.5 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  37.88 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  20.63 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>