192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3343 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03018  predicted permease  99.13 
 
 		 346 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  99.71 
 
 		 346 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  99.71 
 
 		 346 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  99.13 
 
 		 346 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  98.55 
 
 		 346 aa  669    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  100 
 
 		 346 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  99.42 
 
 		 346 aa  675    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  98.84 
 
 		 346 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  83.77 
 
 		 345 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  71.76 
 
 		 373 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  53.35 
 
 		 351 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  52.55 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1637  permease  50.43 
 
 		 354 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1570  permease  52.1 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1113  permease  51.46 
 
 		 352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1593  permease  51.46 
 
 		 352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1509  permease  51.75 
 
 		 352 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0642065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1644  permease  51.8 
 
 		 352 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4731  putative transporter  52.11 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908679  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  49.28 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  50.87 
 
 		 352 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2489  transporter, putative  51.43 
 
 		 376 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1837  permease  51.59 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1850  putative permease  51.59 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1221  transporter, putative  51.3 
 
 		 353 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1706  putative transporter  51.3 
 
 		 353 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0363  putative transporter  51.3 
 
 		 353 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0798  putative transporter  51.3 
 
 		 353 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2005  hypothetical protein  51.03 
 
 		 301 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  44.94 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  27.21 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.7 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  24.11 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  23.19 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  27.53 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  26.17 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  27.86 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  24.72 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  28.02 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  23.6 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  23.12 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  24.73 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  24.71 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  25.81 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  22.83 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  27.47 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.7 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  28.33 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  22.85 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  24.24 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  26.95 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  25.09 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  24.53 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  25.25 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  22.15 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  25.09 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  26.22 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  27.07 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  28.45 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.3 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  25.1 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.48 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  23.44 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  27.07 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  23.11 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  23.22 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  22.47 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  24.71 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  24.71 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  24.72 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  23.55 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  27.47 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  24.81 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  28.68 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  29.32 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  25.37 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  23.96 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  23.48 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  25 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0954  hypothetical protein  27.24 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  24.68 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  24.35 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  21.12 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  25.88 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  21.52 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  25.22 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  24.67 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  24.67 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  23.99 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  24.6 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  21.65 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  21.65 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  25.64 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  24.54 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  24.42 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  24.1 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  23.51 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  22.22 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  26.34 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  23.88 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>