30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0954 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0954  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  698    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.11 
 
 
1040 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  29.81 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  27.13 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  26.74 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  26.74 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  26.74 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  26.36 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  26.36 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  26.36 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  26.36 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  27.54 
 
 
345 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.44 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1637  permease  27.99 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1221  transporter, putative  26.01 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1706  putative transporter  26.01 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0363  putative transporter  26.01 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0798  putative transporter  26.01 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1837  permease  25.7 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1850  putative permease  25.7 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  28.57 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2005  hypothetical protein  27.6 
 
 
301 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  30.91 
 
 
354 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2489  transporter, putative  27.6 
 
 
376 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1593  permease  27.56 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1113  permease  27.56 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  27.51 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1570  permease  27.21 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993908  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  26.77 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  34.25 
 
 
366 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>