132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1637 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1637  permease  100 
 
 		 354 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4731  putative transporter  75.42 
 
 		 352 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908679  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1113  permease  74.86 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1593  permease  74.86 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1570  permease  74.86 
 
 		 352 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1509  permease  74.29 
 
 		 352 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0642065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  74.29 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2489  transporter, putative  76.4 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408266  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1644  permease  74.29 
 
 		 352 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1837  permease  76.2 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1850  putative permease  76.2 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  74 
 
 		 350 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1221  transporter, putative  75.92 
 
 		 353 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1706  putative transporter  75.92 
 
 		 353 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0363  putative transporter  75.92 
 
 		 353 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0798  putative transporter  75.92 
 
 		 353 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  72.78 
 
 		 351 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  73.37 
 
 		 351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2005  hypothetical protein  78.74 
 
 		 301 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  50.57 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  50.43 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  50.43 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  50.43 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  50.43 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  50.43 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  50.14 
 
 		 346 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  50.14 
 
 		 346 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  49.86 
 
 		 346 aa  308  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  49 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  52.34 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  25.86 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.18 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  27.53 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  25.34 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  26.91 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  26.56 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  27.78 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  27.62 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  25.9 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  21.65 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  27.27 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  25.17 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21.77 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  23.51 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  25.22 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  28.02 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.26 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  23.46 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  24.8 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  25.75 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  25.31 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  24.37 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  25.53 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  22.6 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  26.8 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  25.55 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  25.66 
 
 		 351 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  42.03 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  25.2 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  23.34 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  25.1 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  25.22 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  26.5 
 
 		 343 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  25.39 
 
 		 354 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  21.65 
 
 		 338 aa  53.1  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  27.61 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  23.3 
 
 		 361 aa  52.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  27.95 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  23.93 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0954  hypothetical protein  27.99 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  27.95 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  25.53 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  31.58 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  23.53 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  25.21 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  28.75 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  23.67 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  26.52 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  24.23 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  25.1 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  23.08 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  28.33 
 
 		 348 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  21.59 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  26.67 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  23.01 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  21.76 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  26.29 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  23.83 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  22.31 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  23.38 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  22.3 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  21.45 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  22.3 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  22.84 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  31.43 
 
 		 452 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  21.75 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  24.68 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  26.5 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  18.48 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  29.02 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>