139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1837 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1221  transporter, putative  99.72 
 
 		 353 aa  678    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2489  transporter, putative  97.17 
 
 		 376 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1706  putative transporter  99.72 
 
 		 353 aa  678    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0363  putative transporter  99.72 
 
 		 353 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1837  permease  100 
 
 		 353 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1850  putative permease  100 
 
 		 353 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0798  putative transporter  99.72 
 
 		 353 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2005  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1113  permease  83.29 
 
 		 352 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1593  permease  83.29 
 
 		 352 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1570  permease  83 
 
 		 352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4731  putative transporter  83 
 
 		 352 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908679  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1644  permease  82.72 
 
 		 352 aa  550  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1509  permease  81.02 
 
 		 352 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0642065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  81.02 
 
 		 352 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1637  permease  76.2 
 
 		 354 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  73.84 
 
 		 350 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  67.81 
 
 		 351 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  68.38 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  51.59 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  51.59 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  51.59 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  51.59 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  51.43 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  51.3 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  51.3 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  51.01 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  51.01 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  50 
 
 		 373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  49.28 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.91 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  27.31 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  28.79 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  27.38 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.13 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  23.35 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  23.48 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  28.32 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  26.56 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  27.76 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  26.5 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  23.1 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  36.05 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  24.61 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  25.91 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  26.23 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  27.48 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.91 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  27.27 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0954  hypothetical protein  25.7 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  25.38 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  25 
 
 		 324 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  31.3 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  24.19 
 
 		 357 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  25.47 
 
 		 364 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  25.11 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  22.87 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  28.05 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  23.76 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  23.22 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  36.99 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  25.22 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.14 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.36 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  25.88 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  23.92 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  27.75 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  27.34 
 
 		 301 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  26.32 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  23.92 
 
 		 366 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  22 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  25.1 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  34.78 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  24.58 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  24.19 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  26.12 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  24.48 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  25.62 
 
 		 475 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  26.32 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  22.3 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  26.38 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  24.01 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  24.68 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  27.43 
 
 		 490 aa  46.6  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  23.3 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  27.43 
 
 		 433 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  20.36 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  27.27 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  23.04 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  21.29 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  25.42 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  29.5 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  22.83 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  22.61 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  42.86 
 
 		 367 aa  46.2  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  23.67 
 
 		 300 aa  46.2  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  28.25 
 
 		 489 aa  46.2  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  30.14 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  39.39 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>