151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1859 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1859  permease  100 
 
 		 342 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  55.25 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  53.11 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  49.85 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  52.65 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  53.04 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  49.66 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  44.16 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  39.46 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  41.2 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  40.82 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  41 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  40.45 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  40.45 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  40.45 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  40.45 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  40.45 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  40.45 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  40.45 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  32.56 
 
 		 371 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  32.04 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  32.04 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  31.32 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  31.32 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  33.45 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  31.32 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  37.79 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.91 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  31.32 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  37.75 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  28.79 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  29.17 
 
 		 297 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  34.25 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  29.76 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  29.34 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  29.34 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  27.62 
 
 		 524 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  29.43 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  30.07 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  32.03 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  29.19 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  26.42 
 
 		 524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  32.4 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  40.91 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  34.73 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  29.84 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  27.24 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  37.21 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  42.24 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  25.81 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  24.04 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  38.6 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  32.75 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  23.69 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.57 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  24.65 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.83 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  25 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.99 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  25.53 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  28 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  27.47 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  27.56 
 
 		 620 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25.66 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  21.78 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  31.3 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  30.07 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.49 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  30.41 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  23.97 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  28.48 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  25.54 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  29.77 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  30.26 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  30.37 
 
 		 490 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  19.06 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  29.45 
 
 		 362 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  27.27 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  31.15 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  22.03 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1113  permease  31.15 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1593  permease  31.15 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  28.47 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  23.84 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1644  permease  31.15 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1570  permease  31.15 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1509  permease  31.15 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0642065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4731  putative transporter  31.15 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908679  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  27.63 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  27.86 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  27.86 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  22.17 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  26.36 
 
 		 373 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  20.29 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  21.74 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1221  transporter, putative  30.22 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644067  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.78 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1706  putative transporter  30.22 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0798  putative transporter  30.22 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>