151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1570 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4731  putative transporter  98.01 
 
 		 352 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908679  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1113  permease  99.43 
 
 		 352 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  96.31 
 
 		 352 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1593  permease  99.43 
 
 		 352 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1509  permease  96.59 
 
 		 352 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0642065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1570  permease  100 
 
 		 352 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1644  permease  97.44 
 
 		 352 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2489  transporter, putative  83.85 
 
 		 376 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1837  permease  83 
 
 		 353 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1850  putative permease  83 
 
 		 353 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1221  transporter, putative  82.72 
 
 		 353 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1706  putative transporter  82.72 
 
 		 353 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0363  putative transporter  82.72 
 
 		 353 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0798  putative transporter  82.72 
 
 		 353 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  76.29 
 
 		 350 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1637  permease  75.35 
 
 		 354 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2005  hypothetical protein  84.72 
 
 		 301 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  70.74 
 
 		 351 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  71.02 
 
 		 351 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  51.01 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  51.8 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  51.8 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  51.8 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  51.8 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  51.5 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  51.81 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  51.5 
 
 		 346 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  51.2 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  50.75 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  48.6 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  27.24 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  24.21 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  27.89 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  23.32 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  25.78 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  24.14 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  25.58 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  22.86 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  26.25 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  34.83 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  28.08 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  22.14 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  26.64 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  26.45 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  25 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.14 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  23.21 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  23.19 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  27.43 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  26.03 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  23.53 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  26.36 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  22.44 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  22.96 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  23.76 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.03 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  28.57 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  25.48 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  26.95 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  24.46 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  26.41 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  23.12 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  22.98 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  26.53 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  22.62 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  25.76 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  21.54 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  23.49 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  26.5 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  24.51 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0954  hypothetical protein  27.56 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  27.31 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  36.47 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.08 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  32.61 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.65 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  23.66 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.1 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  31.15 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  25.75 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  24.07 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  22.35 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  25.67 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  20.95 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  26.34 
 
 		 301 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  23.69 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  20.22 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  25.73 
 
 		 351 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  23.5 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  26.78 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  24.03 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  22.9 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  20.87 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  24.03 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.79 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  28.7 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  44.44 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  22.6 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  25.9 
 
 		 503 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>