96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11728 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  100 
 
 		 408 aa  820    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  56.64 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  59.28 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  49.34 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  36.36 
 
 		 466 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  36.48 
 
 		 463 aa  252  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  34.15 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  35.56 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  34.86 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  34.96 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  29.22 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  32.52 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  25.57 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  23.48 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  23.48 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  23.48 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  23.48 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  23.48 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  23.48 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  23.48 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  23.11 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.75 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  26.36 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  24.7 
 
 		 284 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  22.98 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22.43 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  20.63 
 
 		 322 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  23.42 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  18.89 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  21.95 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  22.99 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  20.9 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  23.32 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  21.85 
 
 		 331 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  21.85 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  21.77 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  21.48 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  22.14 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21.22 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  21.77 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  26.81 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  23.88 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  20.38 
 
 		 353 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  37.33 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  26.19 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  21.4 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  21.46 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  23.88 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.88 
 
 		 300 aa  47.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  24.04 
 
 		 336 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  20.42 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  18.73 
 
 		 352 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  21.69 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  22.09 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  37.33 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  18.65 
 
 		 350 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  21.54 
 
 		 338 aa  46.6  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  19.77 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  36 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  22.46 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  21.48 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  36 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  22.46 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  36 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  20.08 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  25.81 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  26.88 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  22.27 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  19.6 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  21.37 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  26.35 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  31.94 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  19.37 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  29.21 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  25.19 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  31.94 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  32.47 
 
 		 293 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  26.35 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  21.81 
 
 		 620 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  24.62 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  24.62 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  29.33 
 
 		 325 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  23.69 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  26.02 
 
 		 352 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  22 
 
 		 351 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  20.6 
 
 		 352 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  24.17 
 
 		 524 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  19.52 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  23.2 
 
 		 307 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>