87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3019 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4258  permease  80.22 
 
 		 466 aa  735    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  100 
 
 		 463 aa  940    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  36.48 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  39.95 
 
 		 424 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  34.01 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  36.03 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  36.79 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  36.41 
 
 		 382 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  36.6 
 
 		 394 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  34.26 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  34.92 
 
 		 406 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  36.9 
 
 		 521 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 782 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 		 836 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  54.76 
 
 		 837 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  46.94 
 
 		 841 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  24.65 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 		 841 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  24.65 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  24.65 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  24.65 
 
 		 346 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  24.65 
 
 		 346 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  24.65 
 
 		 346 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  24.65 
 
 		 346 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  24.65 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  22.89 
 
 		 352 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  47.06 
 
 		 807 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 831 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 787 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  23.85 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  43.28 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 		 846 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  41.86 
 
 		 48 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  22.82 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  21.7 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  42.5 
 
 		 56 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 801 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  23.48 
 
 		 356 aa  47.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  43.9 
 
 		 786 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  43.9 
 
 		 786 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  21.71 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 		 776 aa  46.6  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  26.05 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 806 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 868 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  36.84 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  20.22 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 895 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 		 798 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  48.78 
 
 		 84 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 785 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  21.41 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 861 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0169  YHS domain protein  43.48 
 
 		 103 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 778 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  43.9 
 
 		 56 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 		 816 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 826 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 807 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 842 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  30.63 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  29.51 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 842 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  38.98 
 
 		 57 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 842 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 842 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  43.9 
 
 		 55 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 928 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 787 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 842 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 786 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.29 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  40.43 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  48.78 
 
 		 99 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  30.77 
 
 		 79 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  29.36 
 
 		 342 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 786 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  41.3 
 
 		 56 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  21.65 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  20.95 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 		 777 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  39.13 
 
 		 804 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  25.53 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  20.69 
 
 		 402 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 818 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 823 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 809 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>