81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2511 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2511  permease  100 
 
 
420 aa  843    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  55.26 
 
 
408 aa  467  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  56.94 
 
 
424 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  49.13 
 
 
448 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  34.51 
 
 
463 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  33.75 
 
 
466 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  37.99 
 
 
382 aa  235  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  35.78 
 
 
406 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  38.18 
 
 
406 aa  222  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  35.78 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  30.17 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  34.77 
 
 
521 aa  189  9e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  25.69 
 
 
284 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  30.19 
 
 
370 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.32 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.26 
 
 
363 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  25.97 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  25.97 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  25.97 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  29.82 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  25.97 
 
 
346 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  27.17 
 
 
330 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  25.97 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  25.32 
 
 
346 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  25.32 
 
 
346 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  25.51 
 
 
338 aa  53.5  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  25.32 
 
 
346 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  23.1 
 
 
350 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  24.41 
 
 
331 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  24.41 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  28.95 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  23.56 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  27.03 
 
 
349 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  24.41 
 
 
331 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  25.42 
 
 
367 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  23.28 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  26.43 
 
 
353 aa  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  26.83 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  24.43 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  24.1 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.01 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  27.86 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  26.51 
 
 
325 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  22.26 
 
 
322 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  26.51 
 
 
325 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21 
 
 
296 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  26.51 
 
 
324 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  24.02 
 
 
331 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  23.68 
 
 
333 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  24.42 
 
 
336 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  25 
 
 
393 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  23.62 
 
 
331 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  25.87 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  23.6 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  23.62 
 
 
331 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  24.02 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  27.27 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  23.68 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1706  putative transporter  26.49 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1837  permease  26.49 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1850  putative permease  26.49 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0798  putative transporter  26.49 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1221  transporter, putative  26.49 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0363  putative transporter  26.49 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  20.81 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  23.83 
 
 
325 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  23.74 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  23.4 
 
 
325 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2005  hypothetical protein  26.49 
 
 
301 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  23.74 
 
 
344 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  23.08 
 
 
356 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  19.19 
 
 
302 aa  43.9  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  24.9 
 
 
338 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  26.36 
 
 
359 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  21.77 
 
 
319 aa  43.5  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  23.31 
 
 
389 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  23.31 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  22.58 
 
 
362 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  20.15 
 
 
393 aa  43.1  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  24.03 
 
 
461 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>