104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4258 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3019  permease  79.4 
 
 
463 aa  740    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  100 
 
 
466 aa  944    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  36.36 
 
 
408 aa  269  7e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  38.62 
 
 
424 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  34.86 
 
 
448 aa  252  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  34.33 
 
 
441 aa  242  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  33.75 
 
 
420 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  36.68 
 
 
382 aa  236  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  35.53 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  36.7 
 
 
394 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  37.89 
 
 
521 aa  206  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  33.6 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  59.52 
 
 
837 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  55.81 
 
 
928 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  53.19 
 
 
846 aa  57.4  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
801 aa  56.6  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
826 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 
778 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
826 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 
794 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  50.94 
 
 
831 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  48.94 
 
 
841 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  52.38 
 
 
804 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  48.94 
 
 
798 aa  53.9  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  51.06 
 
 
777 aa  53.9  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  44.64 
 
 
781 aa  53.5  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
796 aa  53.9  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  44.44 
 
 
56 aa  53.5  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
861 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  52.17 
 
 
835 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  53.19 
 
 
786 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 
841 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
806 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  48.98 
 
 
836 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
816 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  46.43 
 
 
773 aa  52  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  51.22 
 
 
786 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
823 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  51.22 
 
 
786 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
787 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
809 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  47.06 
 
 
57 aa  50.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
799 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
782 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 
792 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
772 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
868 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
895 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  45.28 
 
 
56 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  44.68 
 
 
56 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
795 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
785 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
817 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  46.51 
 
 
48 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  48.84 
 
 
49 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 
788 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
817 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  47.62 
 
 
805 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  44.23 
 
 
793 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  21.51 
 
 
363 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  44.9 
 
 
56 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
814 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
776 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 
796 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
787 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
973 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
797 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 
804 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  35.79 
 
 
293 aa  47  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  34.92 
 
 
767 aa  47  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  44.44 
 
 
49 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
908 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
787 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  46.81 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  43.48 
 
 
55 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 
806 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
801 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
833 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
815 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
815 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  39.53 
 
 
48 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
815 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  29.41 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.9 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  42.22 
 
 
737 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  25.39 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 
133 aa  44.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
807 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
818 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  35.71 
 
 
301 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
786 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  40.82 
 
 
821 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0603  YHS domain-containing protein  41.38 
 
 
59 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000661026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  22.79 
 
 
346 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2275  YHS  44.19 
 
 
167 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  22.79 
 
 
346 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  22.79 
 
 
346 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  28.03 
 
 
378 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
1020 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  46.34 
 
 
295 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>