32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2950 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2950  permease  100 
 
 		 521 aa  1029    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  40.2 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  37.89 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  34.73 
 
 		 424 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  32.52 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  34.77 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  36.9 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  31.07 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  34.66 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  35.7 
 
 		 406 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  35.16 
 
 		 382 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  35.97 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  27.51 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  25.26 
 
 		 335 aa  51.6  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  24.5 
 
 		 620 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  23.62 
 
 		 333 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  23.13 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  33.98 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  32.22 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  25.33 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  22.63 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  29.37 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  37.5 
 
 		 324 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  25.34 
 
 		 356 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  23.75 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  31.01 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  31.01 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  32.53 
 
 		 294 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  31.43 
 
 		 363 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  43.5  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  35.8 
 
 		 366 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  35.8 
 
 		 366 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>