55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12977 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  804    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  73 
 
 		 382 aa  541  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  69.9 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  53.33 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  35.56 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  38.46 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  34.86 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  33.64 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  36.11 
 
 		 424 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  35.06 
 
 		 441 aa  216  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  33.17 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  35.7 
 
 		 521 aa  192  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.44 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.92 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  23.62 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  24.9 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  25.37 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  25.45 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  25.67 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  26.72 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  26.72 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3290  hypothetical protein  37.18 
 
 		 79 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  26.72 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  26.72 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  26.72 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  26.72 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  26.72 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  26.72 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  22.96 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  24.11 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  30.09 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  22.99 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.72 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  27.54 
 
 		 352 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  24.81 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  24.53 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  26.5 
 
 		 620 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  25.56 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  25 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  20.3 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  22.66 
 
 		 349 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  26.52 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  24.46 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  24.46 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  27.22 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  25.95 
 
 		 351 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.53 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  26.79 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  24.63 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  26.83 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  35.48 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  23.84 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  21.32 
 
 		 345 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  23.51 
 
 		 356 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  23.18 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>