45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6245 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6245  permease  100 
 
 		 424 aa  842    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  56.97 
 
 		 408 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  62.22 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  50.54 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  38.62 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  39.95 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  36.75 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  33.33 
 
 		 406 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  31.08 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  36.11 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  34.73 
 
 		 521 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  36.29 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  25.29 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  25.08 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  26.82 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  26.82 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  26.82 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  26.82 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  24.51 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  26.35 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  24 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  24.57 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  23.78 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  25.25 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  21.86 
 
 		 620 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  22.01 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.39 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  21.61 
 
 		 302 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  22.04 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  24.68 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  25.22 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  23.74 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  23.74 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  22.29 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  22.29 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  22.29 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  24.1 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  22.29 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  22.29 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  22.29 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  24.73 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.35 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  25.62 
 
 		 345 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>