32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48718 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  100 
 
 
448 aa  899    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  49.78 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  50 
 
 
424 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  51.9 
 
 
420 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  34.86 
 
 
466 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  35.78 
 
 
463 aa  242  9e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  35.16 
 
 
382 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  34.18 
 
 
406 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  32.5 
 
 
406 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  30.27 
 
 
441 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  31.57 
 
 
521 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  31.81 
 
 
394 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.01 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  22.08 
 
 
345 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  26.24 
 
 
390 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  28.78 
 
 
371 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  25.12 
 
 
325 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  28.78 
 
 
325 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  21 
 
 
373 aa  47  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  20.72 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  24.29 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  20.72 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  27.56 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  24.29 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  20.67 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  23.26 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  25.41 
 
 
325 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  25.41 
 
 
325 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  20.83 
 
 
475 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  25.71 
 
 
346 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  30.95 
 
 
368 aa  43.1  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  21.96 
 
 
333 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>