53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2468 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2468  permease  100 
 
 		 394 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  69.9 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  68.22 
 
 		 382 aa  484  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  55.28 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  35.1 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  35.97 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  36.06 
 
 		 466 aa  225  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  35.47 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  35.03 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  32 
 
 		 448 aa  199  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  36.2 
 
 		 521 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  32.2 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.92 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  22.84 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.18 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.63 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  24.03 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.75 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  24.44 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  24.44 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  24.03 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  24.03 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  24.03 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  24.44 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  27.85 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  24.03 
 
 		 346 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  23.7 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  25.95 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  29.93 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  25.17 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  23.62 
 
 		 357 aa  47  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  28.12 
 
 		 350 aa  46.6  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1637  permease  25.94 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  25 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4731  putative transporter  25.82 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908679  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.92 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1113  permease  25.82 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1593  permease  25.82 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  26.13 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  25 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1570  permease  25.82 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  26.84 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  36.56 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  25.53 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  23.93 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  26.84 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  29.66 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  22.53 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1509  permease  26.56 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0642065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2005  hypothetical protein  25.44 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1837  permease  25.44 
 
 		 353 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1850  putative permease  25.44 
 
 		 353 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1644  permease  25.78 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>