131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4564 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4564  permease  100 
 
 
441 aa  885    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  40.2 
 
 
521 aa  256  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  34.33 
 
 
466 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  36.79 
 
 
463 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  33.85 
 
 
382 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  30.64 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  35.06 
 
 
406 aa  196  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  32.28 
 
 
406 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  30.34 
 
 
448 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  29.22 
 
 
408 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  29.5 
 
 
420 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  31.9 
 
 
394 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  51.67 
 
 
928 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  46.3 
 
 
799 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
794 aa  63.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  42.31 
 
 
806 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  47.73 
 
 
804 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
823 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  58.14 
 
 
767 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
861 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  52.5 
 
 
793 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 
809 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  48.94 
 
 
801 aa  59.7  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
788 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  47.92 
 
 
787 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  44.9 
 
 
846 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  52 
 
 
57 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 
1020 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  51.35 
 
 
841 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  23.14 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  55.26 
 
 
56 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  23.14 
 
 
358 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46 
 
 
795 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 
796 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  53.66 
 
 
868 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
841 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
973 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  42.37 
 
 
737 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  48.98 
 
 
786 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
787 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  48.15 
 
 
804 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
786 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  48.08 
 
 
814 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  49.02 
 
 
817 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  49.02 
 
 
817 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
772 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
837 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  48.84 
 
 
805 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
801 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  55.56 
 
 
56 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2219  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.221281  normal  0.0750414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  52.5 
 
 
49 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  42.5 
 
 
49 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  18.87 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  49.02 
 
 
792 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 
908 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
781 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
796 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
833 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  45.24 
 
 
821 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
785 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  52.63 
 
 
56 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
786 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  39.58 
 
 
773 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  51.22 
 
 
47 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
786 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
818 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  47.62 
 
 
48 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  53.66 
 
 
56 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  51.06 
 
 
831 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  40 
 
 
48 aa  50.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
807 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
783 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  22.89 
 
 
332 aa  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  23.83 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  38.89 
 
 
88 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
798 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
787 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  52.38 
 
 
55 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  36.21 
 
 
902 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  21.47 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.53 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
765 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1146  YHS domain protein  42.22 
 
 
59 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0140786 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  56.41 
 
 
56 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 
815 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 
815 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 
846 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 
815 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
826 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
776 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  33.33 
 
 
389 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  50 
 
 
301 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
835 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
782 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  34.92 
 
 
62 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 
777 aa  47.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0020  YHS domain-containing protein  39.58 
 
 
67 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  23.68 
 
 
324 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  20.34 
 
 
213 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>