63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0379 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0379  permease  100 
 
 		 382 aa  751    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12977  hypothetical protein  72 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2468  permease  68.32 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2044  permease  53.62 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11728  Uncharacterized conserved membrane protein, probable transporter  34.15 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  37.4 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  35.01 
 
 		 466 aa  225  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  35.97 
 
 		 463 aa  224  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6245  permease  36.94 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00718863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48718  predicted protein  35.16 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  33.08 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2950  permease  34.84 
 
 		 521 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0705618  normal  0.992984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  27.56 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  22.01 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  28.78 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.35 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  29.59 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  21.72 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  23.95 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  21.85 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  27.11 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  27.69 
 
 		 620 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  26.16 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  25.39 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  25.43 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  25.09 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  22.11 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  26.03 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  25.43 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  26.39 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  24.06 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  25.58 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  25.58 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  25.58 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  25.58 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  25.58 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  23.6 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  25 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  25.58 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  25.58 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  27.43 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  25.58 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  27.84 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  26.85 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  26.4 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.25 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  24.54 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  23.47 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  25.57 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  27.2 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  24.37 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  25 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  22.05 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  25.47 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  25.24 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  28.8 
 
 		 350 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  25.65 
 
 		 341 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  26.2 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  33.04 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3290  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  33.04 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.02 
 
 		 294 aa  43.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  26.79 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>