97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2194 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2194  permease  100 
 
 		 365 aa  698    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  28.45 
 
 		 297 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  28.74 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  32.94 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  31.02 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  28.53 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  28.61 
 
 		 524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  28.06 
 
 		 350 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  31.67 
 
 		 335 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  29.97 
 
 		 343 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  30.35 
 
 		 341 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  29.97 
 
 		 343 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  27.91 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  27.68 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  24.92 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  39.32 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  36.36 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  44.34 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  30.93 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  38.46 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  38.46 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  38.46 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  33.83 
 
 		 300 aa  98.6  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  34.62 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  33.85 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  33.85 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  40.15 
 
 		 358 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  34.15 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  34.15 
 
 		 324 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  40.3 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  49.53 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  46.67 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  32.35 
 
 		 524 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  35.83 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  44.76 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  45.71 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  40.4 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  43.7 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  42.86 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  44.95 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  45.16 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  43.4 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  43.12 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  36.45 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  36.45 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  40 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  36.56 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  30.64 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  29.01 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  22.95 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  28.36 
 
 		 451 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  26.52 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  19.75 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  30.08 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  24.53 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  29.13 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  21.72 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  22.06 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  19.05 
 
 		 324 aa  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  27.07 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  28.57 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  22.09 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  24 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  29.35 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.54 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  24.03 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  25.84 
 
 		 474 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  26.61 
 
 		 367 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2078  permease  34.74 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  26.12 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  33.93 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  29.67 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  26.42 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  26.92 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  29.11 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  22.89 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0586  capsule polysaccharide transport  32.04 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  27.74 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  22.64 
 
 		 359 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  32.04 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  29.17 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2511  permease  27.27 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  22.29 
 
 		 308 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  24.76 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  24.76 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  27.54 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  33.67 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  27.17 
 
 		 311 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>