155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2851 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2851  permease  100 
 
 		 352 aa  663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  63.85 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  64.14 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  50.15 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  60.57 
 
 		 334 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  59.52 
 
 		 368 aa  292  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  53.01 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  52.05 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  38.21 
 
 		 298 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  38.31 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  34.72 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  39.08 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  38.7 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  38.31 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  38.31 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  38.31 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  38.31 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  38.31 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  38.31 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  38.31 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  30.69 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  30.03 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  35.1 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  31.23 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  33.72 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  32.82 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  35.45 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  33 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  37.64 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  32.95 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.32 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  30.63 
 
 		 350 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  31.56 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  31.56 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  31.2 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  31.2 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  33.69 
 
 		 524 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  34.42 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  26.6 
 
 		 524 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  33.45 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  43.65 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  37.13 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  42.86 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  42.86 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  42.06 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  31.32 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  39.06 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  33.77 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.97 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  40.98 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  26.48 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  44.44 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  26.13 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  24.6 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  27.01 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25.17 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  26.32 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  25.5 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.86 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.72 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  27.93 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  28.23 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.32 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  23.83 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  28.19 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.37 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  32.43 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  22.62 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  25.68 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  28.93 
 
 		 451 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  27.46 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  29.01 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  29.01 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  33.33 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.2 
 
 		 365 aa  53.1  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  28.24 
 
 		 474 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  27.11 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  27.61 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  29.1 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  31.76 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  30.4 
 
 		 490 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  28.83 
 
 		 349 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  31.62 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  27.66 
 
 		 475 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  21.93 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  36.14 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  34.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  34.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  23.35 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  34.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  23.35 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  36.47 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  36.71 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  34.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  34.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  34.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  34.94 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  36.71 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  24.53 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>