139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3807 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3807  permease  100 
 
 		 362 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  62.4 
 
 		 350 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  61.71 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  58.18 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  58.18 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  59.94 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  58.08 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  57.73 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  42.19 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  37.12 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  36.84 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  37.6 
 
 		 318 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  37.6 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  38.06 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  31.29 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  32.76 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  31.2 
 
 		 312 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  30.29 
 
 		 524 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  27.68 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  27.81 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  27.81 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  46.15 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  30.94 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  47.01 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  35.59 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  44.44 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  43.59 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  43.59 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.48 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  43.59 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  42.74 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  37.78 
 
 		 524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  42.74 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  42.74 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  42.74 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  42.74 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  42.74 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  42.74 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  40.82 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  39.84 
 
 		 297 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  39.84 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  35.14 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  32.18 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  31.61 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  40.91 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  42.06 
 
 		 332 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  42.96 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  43.65 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  41.18 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  41.22 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  40.94 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  38.17 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  40.48 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  21.35 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  22.61 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  24.47 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  21.97 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  27.35 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  27.59 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  36.36 
 
 		 620 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  25.48 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  32.04 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  34.09 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.01 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.7 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  27.5 
 
 		 611 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  27.74 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  28.12 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  31.71 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  22.42 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.89 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  26.24 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  28.57 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  28.91 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.4 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  21.76 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  20.4 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  29.56 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  26.21 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  20.1 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  30.1 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  28.47 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  26.06 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  35.29 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  26.06 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  19.44 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  29.91 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  31.08 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  33.82 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  26.81 
 
 		 301 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  33.82 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  27.45 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  25.58 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  27.72 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  26.47 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  24.03 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  26.47 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  26.21 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  23.66 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>